Kelly McGillis si dlouho nepřiznala, jak to vlastně se svou sexualitou má. Zkoušela to dlouho s muži, dokonce má za sebou dvě nevydařená manželství. Prý o tom, že je lesbička, věděla už od dvanácti let. Jenomže tenkrát pro ni bylo těžké vyjít s pravdou ven. Její rodina byla navíc silně věřící, takže si myslela, že když se jí něco špatného v životě stalo, tak to bylo pro to, že ji bůh trestá za homosexualitu.

A k takovému sebemrskačství patřil i otřesný zážitek v 1982, kdy ji znásilnili ve vlastním domě. K tomu, že je lesbička, se přiznala až v 51 letech, kdy už byla na podobná vyznání společnost lépe připravena. „Strašně se mi ulevilo,“ řekla. Konečně může být sama sebou a trávit čas s tím, s kým opravdu chce.

Z bývalých vztahů s muži má dvě dospívající dcery.